自2002年X檔案的六年后,前聯(lián)邦探員丹娜·斯科莉(吉蓮·安德森 Gillian Anderson 飾)調(diào)任某教會(huì)醫(yī)院擔(dān)任醫(yī)師,??怂埂つ碌拢ù笮l(wèi)·杜楚尼 David Duchovny 飾)則過(guò)著隱居的生活,繼續(xù)著對(duì)超自然現(xiàn)象的關(guān)注。某天,F(xiàn)BI探員前來(lái)請(qǐng)求他們的幫助。原來(lái)一段時(shí)間內(nèi),維吉尼亞州接連有數(shù)名女子神秘失蹤,其中甚至包括一名聯(lián)邦探員。由于神父約瑟夫(Billy Connolly 飾)聲稱(chēng)看到了犯罪畫(huà)面,因此FBI希望對(duì)超自然案件有著豐富經(jīng)驗(yàn)的穆德和斯科莉協(xié)助調(diào)查。然而隨著調(diào)查的深入,穆德和斯科莉卻發(fā)現(xiàn)案件的黑暗遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出他們的想象。這對(duì)合作多年的搭檔面臨著巨大的考驗(yàn)…… 本片為同名美劇的第二部劇場(chǎng)版。